Мне потом объяснили, что это нормально, неподвижные шестерни иногда не могут подключиться друг к другу и их нужно провернуть, слегка потравив сцепление и надавливая на лапку кпп стоя на месте.
Возможно зависит от конкретной кпп, потому что у людей на разных мотоциклах может работать по-разному.